Отличительной особенностью лазерного сканирующего микроскопа LSM 780 является уникальная система детекции отраженного сигнала. Благодаря сверхчувствительному 32-канальному GaAsP датчику (спектральный детектор на основе полупроводникового материала галлий-мышьяк-фосфор) эта модель отличается повышенной чувствительностью и улучшенным соотношением сигнал/шум. Как известно, чувствительность стандартных фотоумножителей максимальна в коротковолновой части спектра и снижается по мере увеличения длины волны. В системе детекции LSM 780 отраженный сигнал в фиолетовой части спектра анализируется стандартными фотоумножителями, в зеленой — GaAsP детекторами, и в красной — охлаждаемыми фотоумножителями. Таким образом реализуется сбор сигнала с максимальной чувствительностью и практически без потерь.
Благодаря инновационной системе детекции возможно проведение флюоресцентной корреляционной спектроскопии и подсчет фотонов без дополнительных внешних датчиков.
Благодаря реализованным в LSM 780 достижениям этот микроскоп в 2011 году вошел в топ-100 инновационных технологий по версии журнала R&D.
В составе LSM 780 доступен уникальный ультрафиолетовый лазер с длиной волны 355 нм для проведения фотоманипуляций.